Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24AO95486 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24AO95486 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms