Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPBO95292 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPBO95292 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPBO95292 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPBO95292 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPBO95292 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPBO95292 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPBO95292 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPBO95292 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPBO95292 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPBO95292 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPBO95292 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPBO95292 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPBO95292 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms