Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1O95273 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1O95273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1O95273 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms