Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR47O94967 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR47O94967 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR47O94967 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR47O94967 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR47O94967 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR47O94967 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR47O94967 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR47O94967 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR47O94967 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR47O94967 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR47O94967 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR47O94967 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR47O94967 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR47O94967 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR47O94967 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR47O94967 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR47O94967 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR47O94967 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR47O94967 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR47O94967 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms