Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A2O94788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms