Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB2O75838 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB2O75838 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB2O75838 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB2O75838 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB2O75838 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIB2O75838 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB2O75838 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB2O75838 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB2O75838 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB2O75838 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB2O75838 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB2O75838 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB2O75838 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB2O75838 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB2O75838 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB2O75838 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB2O75838 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB2O75838 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB2O75838 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB2O75838 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB2O75838 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB2O75838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms