Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3JO75822 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF3JO75822 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3JO75822 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3JO75822 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms