Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LANCL1O43813 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms