Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMC8O43402 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMC8O43402 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMC8O43402 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMC8O43402 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMC8O43402 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EMC8O43402 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMC8O43402 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMC8O43402 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMC8O43402 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC8O43402 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC8O43402 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms