Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK2O43353 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms