Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLGNO14967 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLGNO14967 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLGNO14967 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLGNO14967 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLGNO14967 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLGNO14967 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLGNO14967 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLGNO14967 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLGNO14967 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLGNO14967 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLGNO14967 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLGNO14967 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLGNO14967 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms