Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GIPC1O14908 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms