Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF6O14896 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF6O14896 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF6O14896 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF6O14896 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF6O14896 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF6O14896 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF6O14896 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF6O14896 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF6O14896 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF6O14896 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF6O14896 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF6O14896 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF6O14896 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF6O14896 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF6O14896 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF6O14896 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF6O14896 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
IRF6O14896 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF6O14896 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF6O14896 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF6O14896 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF6O14896 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF6O14896 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF6O14896 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms