Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE40O14503 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms