Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2CO00762 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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