Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PODXLO00592 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PODXLO00592 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PODXLO00592 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXLO00592 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXLO00592 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXLO00592 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXLO00592 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXLO00592 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXLO00592 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXLO00592 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXLO00592 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXLO00592 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXLO00592 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXLO00592 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXLO00592 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXLO00592 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXLO00592 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXLO00592 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXLO00592 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXLO00592 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXLO00592 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXLO00592 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXLO00592 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXLO00592 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXLO00592 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXLO00592 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms