Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DFFAO00273 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DFFAO00273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DFFAO00273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DFFAO00273 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DFFAO00273 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DFFAO00273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DFFAO00273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DFFAO00273 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DFFAO00273 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DFFAO00273 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DFFAO00273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DFFAO00273 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DFFAO00273 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DFFAO00273 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DFFAO00273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DFFAO00273 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DFFAO00273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DFFAO00273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DFFAO00273 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DFFAO00273 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DFFAO00273 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DFFAO00273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DFFAO00273 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DFFAO00273 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DFFAO00273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DFFAO00273 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms