Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNAP23O00161 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms