Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QR89 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QR89 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QR89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QR89 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QR89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QR89 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QR89 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QR89 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QR89 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QR89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QR89 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms