Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H7C1H1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H7C1H1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H7C1H1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H7C1H1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1H1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1H1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1H1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1H1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1H1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1H1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1H1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms