Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3BRM9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3BRM9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3BRM9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BRM9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BRM9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BRM9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BRM9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3BRM9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms