Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQV1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H3BQV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
H3BQV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
H3BQV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H3BQV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H3BQV1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H3BQV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H3BQV1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H3BQV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BQV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQV1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQV1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BQV1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BQV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BQV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BQV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BQV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BQV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BQV1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BQV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BQV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BQV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BQV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BQV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms