Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNRNPCL3B7ZW38 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNRNPCL3B7ZW38 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms