Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE1LA8MT33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1LA8MT33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms