Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC4A6NH21 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC4A6NH21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC4A6NH21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC4A6NH21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC4A6NH21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC4A6NH21 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms