Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEMP2A6NFY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms