Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C5orf60A6NFR6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf60A6NFR6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.6 ms