Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIT2A6NDA9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIT2A6NDA9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms