Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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USP35Q9P2H5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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USP35Q9P2H5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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