Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms