Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB9BQ9NP90 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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