Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms