Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms