Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNPPD1Q9BV87 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CNPPD1Q9BV87 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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