Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms