Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms