Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN18Q96SJ8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms