Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TTC21AQ8NDW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTC21AQ8NDW8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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