Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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