Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms