Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms