Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 691.5 ms