Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27BQ5VT28 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms