Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms