Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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SYT16Q17RD7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SYT16Q17RD7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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SYT16Q17RD7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SYT16Q17RD7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SYT16Q17RD7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYT16Q17RD7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT16Q17RD7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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