Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FXNQ16595 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms