Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms