Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms