Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms