Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms